Τρεις νίκες θα χρειαστεί μια ομάδα για να φτάσει στην κατάκτηση του Κυπέλλου. Η κολυμβητική ομοσπονδία (ΚΟΕ) ανακοίνωσε πως μόλις οκτώ ομάδες δήλωσαν συμμετοχή στα προκριματικά του θεσμού.

Η κάτοχος του τίτλου Βουλιαγμένη, ο Ολυμπιακός, η Χίος, ο Παναθηναϊκός, ο Πανιώνιος, το Αργοστόλι, η Ηλιούπολη και ο Νηρέας Λαμίας θα μπουν στην κληρωτίδα της 28ης Μαρτίου.

Τα τέσσερα ζευγάρια που θα αναδειχθούν θα δώσουν νοκ άουτ αγώνες στις 10 Απριλίου. Το φάιναλ φορ της διοργάνωσης θα διεξαχθεί το διήμερο 1η με 2 Ιουνίου, ενώ σε περίπτωση που μια εκ των Ολυμπιακού ή Βουλιαγμένη έχει περάσει στο φάιναλ φορ, αλλά και σε εκείνο του Champions League, τότε η διοργάνωση του κυπέλλου θα μετατεθεί για τις 7 και 8 Ιουνίου.

Το 2012 το φάιναλ φορ είχε διεξαχθεί με μεγάλη επιτυχία στο Αργοστόλι.