Από την Πειθαρχική Επιτροπή της FIFA πέρασαν αρκετές Ομοσπονδίες και μεταξύ αυτών και η Ελληνική για την συμπεριφορά οπαδών.

Η ΕΠΟ λοιπόν τιμωρήθηκε από την Παγκόσμια Ομοσπονδία με πρόστιμο 25.000 ευρώ για ένα σύμβολο (φαίνεται στην φωτογραφία δεξιά) σε πανό στο ματς της Εθνικής ομάδας με την Σλοβακία στις 11 Οκτωβρίου και το οποίο καταγγέλθηκε από την οργάνωση FARE (Football against racism in Europe).

Επίσης, από τη FIFA επιβλήθηκαν ποινές κατά της Σκωτίας και της Ρουμανίας. Η ομοσπονδία της Ρουμανίας θα καταβάλει πρόστιμο 10.000 ελβετικών φράγκων για τον αγώνα με την Εσθονία στις 15 Οκτωβρίου και η Σκωτία το ίδιο ποσό για ελλιπή μέτρα ασφαλείας στο παιχνίδι με την Κροατία την ίδια ημέρα.