Ο Σέρχιο Ερνάντες ολοκλήρωσε την παρουσία του στον πάγκο της εθνικής Αργεντινής, ρίχνοντας τίτλους τέλους σε μία σπουδαία πορεία.

Ο Ερνάντες κάθισε στον πάγκο των "αλμπισελέστε" από το 2005 έως το 2010 και από το 2015 έως το 2021. Στις δύο παρουσίες του στον πάγκο της Αργεντινής οδήγησε την χώρα του σε ένα ασημένιο μετάλλιο σε Παγκόσμιο Κύπελλο (2019), ένα χάλκινο σε Ολυμπιακούς Αγώνες (2008), ένα χρυσό (2019) τέσσερα ασημένια (2005, 2007, 2015, 2017) και ένα χάλκινο μετάλλιο (2009) σε Παναμερικανικούς Αγώνες και ένα χρυσό (2008) και ένα χάλκινο μετάλλιο (2006) σε αγώνες Νοτίου Αμερικής. Παράλληλα είναι ο προπονητής με τα περισσότερα παιχνίδια στον πάγκο των Αργεντινών με 116.