Αποκτήθηκε το καλοκαίρι του 2007 από την Πόρτο και έχει διαγράψει μια εξαιρετική διαδρομή στη Ρεάλ Μαδρίτης από τότε μέχρι σήμερα. Ο Πέπε ανανέωσε την συνεργασία του με την "Βασίλισσα" ως το καλοκαίρι του 2017 και θα συμπληρώσει δεκαετία με την φανέλα της.

Οι δύο πλευρές ήταν σε επαφές το τελευταίο διάστημα και κατέληξαν σε συμφωνία. Ο 32χρονος αποτελεί αναπόσπαστο κομμάτι της πορείας των Μαδριλένων, ο Ράφα Μπενίτεθ ήθελε να τον διατηρήσει στο ρόστερ της ομάδας και όλα πήραν τον δρόμο τους, με το deal να επιτυγχάνεται ανάμεσα στις δυο πλευρές.