Το καλοκαίρι, ο Πανελλήνιος έκανε προσπάθεια να επιστρέψει στις εθνικές κατηγορίες, μέσω συγχώνευσης με τον Γυμναστικό Λάρισας. Η ΕΟΚ δεν έκανε δεκτή την ομάδα που θα προέκυπτε από τη συγκεκριμένη συγχώνευση και θα είχε ως έδρα την Κυψέλη. Στη συνέχεια, οι άνθρωποι του ιστορικού συλλόγου κατέθεσαν προσφυγή στο ΑΣΕΑΔ, καθώς δεν πείστηκαν από τα επιχειρήματα της Ομοσπονδίας.

Εν τέλει, το Ανώτατο Αθλητικό δικαιοδοτικό όργανο τελικά έκρινε ότι ήταν σωστή η απόφαση της ΕΟΚ, η οποία είχε ως βασικό επιχείρημα πως δεν δικαιολογείται συγχώνευση ομάδων από διαφορετικές Περιφέρειες. Ως εκ τούτου, ο Πανελλήνιος δεν αγωνιστεί πουθενά την αγωνιστική περίοδο 2017-2018.